Fakultas Psikologi (FP) Unika Atma Jaya secara resmi didirikan pada 8 Juni 1992 dengan satu program studi, yakni Program Sarjana. Baru sesudahnya, 2005, berdiri Program Magister Psikologi Profesi, yang hingga kini menyelenggarakan tiga jurusan: Psikologi Industri & Organisasi, Psikologi Klinis dan Psikologi Pendidikan. Program Magister Psikologi lainnya, yang bercorak pendidikan akademik, berdiri 2013 dengan dua peminatan: yakni Psikologi Sosial Kesehatan dan Psikologi Temu Budaya. Empat tahun kemudian, tepatnya 2017, berdiri program studi S-3.  

Program Sarjana meraih status akreditasinya dengan lancar, yang kala itu dikenal dengan “Terdaftar”, kemudian “Diakui” dan terakhir “Disamakan”. Sesudahnya berganti sistem akreditasi, dan secara konsisten mempertahankan Status Akreditasi “A” dari Badan Akreditasi Nasional. Pun demikian dengan Status Akreditasi Magister Psikologi Profesi, yang sejak awal meraih status akreditasi “A”, dan hingga kini status tersebut mampu dipertahankan. Program Magister Psikologi berstatus akreditasi “B”, sedangkan Program Doktor dengan status akreditasi “Baik”.