Fakultas Bisnis dan Inovasi Sosial (FBIS) Unika Atma Jaya merupakan fakultas tertua yang didirikan sejak 11 Juli 1960 dan resmi beroperasi pada Oktober 1960. Hingga saat ini, FBIS Unika Atma Jaya telah menjalankan 11 program studi yang terdiri dari 6 Program Tingkat Sarjana (Strata 1), 4 Program Tingkat Magister (Strata 2), dan 1 Program Profesi. Program Tingkat Sarjana (Strata 1) FEB terdiri dari Program Studi Manajemen, Akuntansi ,Ekonomi Pembangunan, Administrasi Bisnis, Ilmu Komunikasi dan Pariwisata

Program Magister FBIS yang pertama kali dibuka pada tahun 1993, hingga kini telah terdiri dari Magister Manajemen, Magister Akuntansi, dan Magister Ekonomi Terapan, Magister Administrasi Bisnis (MAB). Sementara itu untuk Program Profesi, FBIS mengelola Program Pendidikan Profesi Akuntansi (PPAk) yang perijinan awal telah berlaku sejak tahun akademik 2010/2011. Keseluruhan Program Studi FBIS Unika Atma Jaya telah mendapatkan akreditasi dari Badan Akreditasi Nasional Perguruan Tinggi (BAN-PT). Fakultas Bisnis dan Inovasi Sosial Unika Atma Jaya menyiapkan lulusan terbaik berkelanjutan untuk siap bekerja secara profesional yang memenuhi kualifikasi global.